การปกครองคณะสงฆ์ฝ่ายธรรมยุติกนิกาย
มีมหาเถรสมาคม (มส.) และเจ้าคณะใหญ่คณะธรรมยุต
เป็นองค์กรและผู้ปกครองสูงสุด

ถ้าหากสมเด็จพระสังฆราช สกลมหาสังฆปริณายก เป็นฝ่ายธรรมยุต
ก็ทรงดำรงตำแหน่งเจ้าคณะใหญ่คณะธรรมยุตด้วย

เนื่องจากสมเด็จพระญาณสังวร สมเด็จพระสังฆราช สกลมหาสังฆปริณายก
สมเด็จพระสังฆราชพระองค์ที่ 19 แห่งกรุงรัตนโกสินทร์
ทรงสิ้นพระชนม์เมื่อวันพฤหัสบดีที่ 24 ตุลาคม 2556
ปัจจุบันจึงได้มีการแต่งตั้ง สมเด็จพระวันรัต (จุนท์ พฺรหฺมคุตฺโต ป.ธ.9)
เจ้าอาวาสวัดบวรนิเวศวิหาร เป็นเจ้าคณะใหญ่คณะธรรมยุต

ถัดจาก เจ้าคณะใหญ่ ก็มี เจ้าคณะภาค เป็นผู้ปกครอง

แต่เนื่องจากวัดและคณะสงฆ์ฝ่ายธรรมยุติกนิกาย
มีจำนวนน้อยกว่าฝ่ายมหานิกาย
พระเถระรูปเดียวจึงต้องดำรงตำแหน่งเจ้าคณะภาคหลายๆ ภาค

เจ้าคณะภาค 1-2-3-12-13
สมเด็จพระธีรญาณมุนี (สมชาย วรชาโย ป.ธ.8)
วัดเทพศิรินทราวาส กรุงเทพฯ

ปกครองพระภิกษุ-สามเณร ฝ่ายธรรมยุติกนิกาย
ในภาค 1-2-3-12-13 รวม 5 ภาค
จำนวน 19 จังหวัด 24 เขต/อำเภอ 49 แขวง/ตำบล ได้แก่

ภาค 1 กรุงเทพมหานคร สมุทรปราการ นนทบุรี ปทุมธานี

ภาค 2 พระนครศรีอยุธยา อ่างทอง สระบุรี ลพบุรี

ภาค 3 สิงห์บุรี อุทัยธานี ชัยนาท

ภาค 12 ปราจีนบุรี สระแก้ว และนครนายก ฉะเชิงเทรา

ภาค 13 ชลบุรี ระยอง จันทบุรี ตราด

เจ้าคณะภาค 4-5-6-7
พระพรหมเมธี (จำนงค์ ธมฺมจารี น.ธ.เอก)
วัดสัมพันธวงศ์ กรุงเทพฯ

ปกครองพระภิกษุ-สามเณร ฝ่ายธรรมยุติกนิกาย
ในภาค 4-5-6-7 รวม 4 ภาค
จำนวน 17 จังหวัด 15 อำเภอ 60 ตำบล ได้แก่

ภาค 4 นครสวรรค์ ชัยนาท เพชรบูรณ์

ภาค 5 ตาก อุตรดิตถ์ พิษณุโลก สุโขทัย กำแพงเพชร พิจิตร

ภาค 6 ลำปาง แพร่ น่าน พะเยา เชียงราย

ภาค 7 เชียงใหม่ ลำพูน แม่ฮ่องสอน

เจ้าคณะภาค 8
พระธรรมเจติยาจารย์ (บุญเรือน ปุญฺญโชโต ป.ธ.4)
วัดพระศรีมหาธาตุฯ บางเขน กรุงเทพฯ

ปกครองพระภิกษุ-สามเณร ฝ่ายธรรมยุติกนิกาย
ในภาค 8 จำนวน 5 จังหวัด 44 อำเภอ 165 ตำบล
ได้แก่ อุดรธานี เลย หนองคาย สกลนคร หนองบัวลำภู

เจ้าคณะภาค 9
พระธรรมดิลก (สมาน สุเมโธ ป.ธ.9)
วัดป่าแสงอรุณ จ.ขอนแก่น

ปกครองพระภิกษุ-สามเณร ฝ่ายธรรมยุติกนิกาย
ในภาค 9 จำนวน 4 จังหวัด 33 อำเภอ 119 ตำบล
ได้แก่ ขอนแก่น มหาสารคาม กาฬสินธุ์ ร้อยเอ็ด

เจ้าคณะภาค 10
พระธรรมฐิติญาณ (ศรีจันทร์ ปุญฺญรโต น.ธ.เอก)
วัดบึงพระลานชัย จ.ร้อยเอ็ด

ปกครองพระภิกษุ-สามเณร ฝ่ายธรรมยุติกนิกาย
ในภาค 10 จำนวน 6 จังหวัด 55 อำเภอ 87 ตำบล ได้แก่
อุบลราชธานี ยโสธร นครพนม มุกดาหาร อำนาจเจริญ ศรีสะเกษ

เจ้าคณะภาค 11
พระพรหมวิสุทธาจารย์ (มนตรี คณิสฺสโร ป.ธ.5)
วัดเครือวัลย์ กรุงเทพฯ

ปกครองพระภิกษุ-สามเณร ฝ่ายธรรมยุติกนิกาย
ในภาค 11 จำนวน 4 จังหวัด 29 อำเภอ 51 ตำบล
ได้แก่ นครราชสีมา ชัยภูมิ บุรีรัมย์ สุรินทร์

เจ้าคณะภาค 14-15
พระพรหมมุนี (สุชิน อคฺคชิโน ป.ธ.1-2, น.ธ.เอก)
วัดราชบพิธสถิตมหาสีมาราม กรุงเทพฯ

ปกครองพระภิกษุ-สามเณร ฝ่ายธรรมยุติกนิกาย
ในภาค 14-15 รวม 2 ภาค จำนวน 8 จังหวัด 9 อำเภอ 13 ตำบล
ได้แก่ นครปฐม กาญจนบุรี สุพรรณบุรี สมุทรสาคร
สมุทรสงคราม ราชบุรี เพชรบุรี ประจวบคีรีขันธ์

เจ้าคณะภาค 16-17-18
พระสาสนโสภณ (พิจิตร ฐิตวณฺโณ ป.ธ.9)
วัดโสมนัสวรวิหาร กรุงเทพฯ

ปกครองพระภิกษุ-สามเณร ฝ่ายธรรมยุติกนิกาย
ในภาค 17-18-19 รวม 3 ภาค จำนวน 13 จังหวัด 36 อำเภอ 30 ตำบล
ได้แก่ นครศรีธรรมราช สุราษฎร์ธานี ชุมพร ภูเก็ต พังงา
กระบี่ ระนอง สงขลา สตูล พัทลุง ปัตตานี ยะลา นราธิวาส


สมเด็จพระวันรัต (จุนท์ พฺรหฺมคุตฺโต ป.ธ.9)


สมเด็จพระธีรญาณมุนี (สมชาย วรชาโย ป.ธ.8)


พระพรหมเมธี (จำนงค์ ธมฺมจารี น.ธ.เอก)


พระธรรมเจติยาจารย์ (บุญเรือน ปุญฺญโชโต ป.ธ.4)


พระธรรมดิลก (สมาน สุเมโธ ป.ธ.9)


พระธรรมฐิติญาณ (ศรีจันทร์ ปุญฺญรโต น.ธ.เอก)


พระพรหมวิสุทธาจารย์ (มนตรี คณิสฺสโร ป.ธ.5)


พระพรหมมุนี (สุชิน อคฺคชิโน ป.ธ.1-2, น.ธ.เอก)


พระสาสนโสภณ (พิจิตร ฐิตวณฺโณ ป.ธ.9)

-------------------------------------------